Операція з депортації розпочалась рано вранці 18 травня 1944 року і
закінчилася о 16:00 20 травня. Для її проведення було задіяно війська НКВС кількістю понад 32
тисячі осіб. Депортованим відводили від декількох хвилин до півгодини на збори,
після чого їх на вантажівках транспортували до залізничних станцій. Звідти
ешелони з ними відправляли до місць заслання. За спогадами очевидців, тих, хто
чинив опір або не міг іти, часто розстрілювали на місці.